向水日菜子（川荣李奈配音）是一位冲浪爱好者，对大海有着强烈的热情和真挚的喜爱，只有在风口浪尖处，她才能够感受到自己真正的在活着，可是别看日菜子在海上神气活现，在生活里，她其实是一个多思多虑的女孩，对未来感到深深的迷惘。一场活在让日菜子结识了名为雏罂粟港（片寄凉太配音）的消防员，勇敢正直的港很快就吸引了日菜子的注意，两人一拍即合走到了一起，开始了一段充满了幸福的恋情。可是好景不长，一场海难夺走了港的生命，日菜子无法接受竟然是自己挚爱的大海夺走了她最爱的人。某日，陷入消沉许久的日菜子哼起了两人在一起时经常会唱的那首歌，令她没有想到的是，港竟然出现在了自己的面前。

黎明叛乱后，夏尔前往地球并遇到了一位拥有神秘力量的女孩拉拉·苏恩。 与此同时，阿姆罗的父亲 Tem Ray 正在致力于 RX-78 开发项目。得知吉恩机动战士开发关键人物米诺夫斯基博士叛逃后，他前往月球。历史上第一场机动战士之间的战斗在月球表面的暮色地带展开。 接下来是宇宙世纪0079，距离地球最远的太空都市SIDE 3以吉恩公国的名义向地球联邦政府发动独立战争。 一个暴力动乱的时代开始了，一半的人类人口将被杀害……

宇宙世纪0068年，居住在SIDE3的慕佐自治共和国议长发表完《完全独立宣言》后意外身亡，由此引发了连番的动乱，许多人的命运也就此发生根本转变。转眼来到宇宙世纪0074年，爱德华·玛斯（池田秀一 配音）以夏亚·阿兹纳布的身份进入吉恩自治共和国国防军官学校学习。在那里，他与来自SIDE3的名门子弟格尔玛（柿原彻也 饰）互相赏识，成为模拟好友。